TWAS atlas 2.0:一个更新的数据资源,用于转录组范围的关联研究
Hao Gao1,2,3, Congfan Bu1,2, Si Zheng4,5
1National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation, Beijing 100101, China.
Nucleic acids research
|November 18, 2025
概括
通过整合更多的数据和分析工具,TWAS Atlas 2.0 增强了基因特征关联发现. 这种资源有助于研究人员了解基因表达.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 系统生物学 系统生物学
背景情况:
- 全转录组关联研究 (TWAS) 整合了GWAS和eQTL数据,以识别与特征相关的基因.
- TWAS Atlas是一个精心策划的资源,用于分析基因特征关联.
- 之前的版本有助于基因特征关联分析.
研究的目的:
- 以最新的TWAS发现和分析能力更新和扩展TWAS Atlas资源.
- 加强对复杂特征的基因特征关联的整合和分析.
- 为研究人员提供先进的工具来探索特征的遗传调节.
主要方法:
- 策划并整合了来自文学的最新TWAS结果.
- 整合了GWAS数据集,用于在各种表型中扩展TWAS分析.
- 通过文献信息提取来增强知识图.
- 开发了多维交互式分析模块 (功能丰富,孟德尔随机化,局部化,精细映射).
主要成果:
- 现在TWAS Atlas 2.0包括676,198个基因特征关联,涵盖590个特征和24,870个基因.
- 显著增强知识图表,提高了可用性和分析能力.
- 新的交互式模块可以全面探索因果基因特征关系.
- 扩大了表型覆盖范围,并将基因特征关联数量增加了60%以上.
结论:
- TWAS Atlas 2.0是一个显著增强的资源,用于探索基因特征关联.
- 更新后的平台为了解复杂特征的遗传基础提供了强大的工具.
- 有助于更深入地了解基因表达及其在人类疾病和特征中的调节作用.
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