在非目标有机气溶分析中的数据独立实验中的CID片段注释:展示一个易于使用的工具

科学领域:

• 分析化学 分析化学
• 质谱测量质量谱测量
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.

背景情况:

• 数据独立获取 (DIA) 方法,如完整的MS/AIF,对于非目标分析 (NTA) 是有价值的,但需要强大的数据处理.
• 在DIA实验中手动分析CID碎片是耗时且主观的.
• 现有的方法可能无法充分利用DIA数据的信息内容来进行全面的样本分析.

研究的目的:

• 提出一个开源工具,用于自动分析和注释CID从前体离子碎片.
• 在非目标HPLC-UHRMS分析中增强全MS/AIF测量的实用性.
• 为了促进前体离子的结构阐明,并改善NTA工作流程.

主要方法:

• 开发一个开源软件工具来处理MS/AIF数据.
• 该工具用于分析28种标准化合物的混合物.
• 自动碎片识别和注释与手动分析的比较.
• 对已识别的化合物的配方预测准确性的评估.

主要成果:

• 该工具自动识别和注释碎片,在71%的化合物中获得与手工分析相匹配或更好的结果.
• 在测试的标准化合物中,配方预测准确度达到96%.
• 该方法提高了原始数据文件的信息价值,并提高了碎片离子的检测极限.
• 工作流提供了更公正的样本视图,这对NTA至关重要.

结论:

• 开发的开源工具简化和增强了DIA质谱数据的分析.
• 自动化的断片注释和识别显著提高了数据质量,加速了科学发现.
• 该工具有效用于前体离子的结构分析,并支持为NTA创建数据库.