基于混合捕获的FoundationOne®CDx对非小细胞肺癌可采取行动的改变的覆盖范围,与基于安普利康的OncomineDXX相比

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 分子诊断学 分子诊断学

背景情况:

• 基金会One®CDx (F1CDx) 和Oncomine Dx目标测试 (ODxTT) 是非小细胞肺癌 (NSCLC) 的商业下一代测序试验.
• 这些测试使用不同的方法来确定用于治疗选择的预测生物标志物.

研究的目的:

• 为了比较F1CDx在NSCLC中检测到的可操作的基因组改变数量与ODxTT.
• 假设F1CDx比ODxTT检测到更多可操作的变化.

主要方法:

• 通过F1CDx检测的现实世界NSCLC基因组改变 (GA) 与基于覆盖规格的理论ODxTT检测的比较.
• 使用NCCN指南和FDA瘤药物批准,评估GA的临床可行性.

主要成果:

• F1CDx发现了频繁可操作的变异,包括KRAS G12C,EGFR和MET突变.
• ODxTT规范显示检测了临床显著标记物的子集 (例如,EGFR 83%,RET 76%),但缺乏ALK,MET,NTRK,TMB和MSI-High的覆盖.
• 与F1CDx相比,ODxTT可能无法在42%的NSCLC组织样本中报告至少一个可操作的生物标志物.

结论:

• 基于混合捕获的NGS,以F1CDx为例,可以捕获高级NSCLC中更多可操作的基因组改变.
• 基于AMPlicon的NGS,如ODxTT,在NSCLC的综合生物标志物检测方面可能存在局限性.