头癌中的HPV整合:下游拼接事件和表达比率与糟糕的结果相关
Shiting Li1, Shaomiao Xia1, Maria Lawas1
1University of Michigan-Ann Arbor, Ann Arbor, Michigan, United States.
概括
人类乳头瘤病毒 (HPVint) 在头癌中的集成与新的致癌网络和潜在的生物标志物有关. RNA分析揭示了结果更差的患者子集,为HPV相关的HNSCC推进了精确瘤学.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 人类乳头瘤病毒整合 (HPVint) 涉及HPV相关的癌症,如头部和部状细胞癌 (HNSCC).
- 尽管对HPVint对人类DNA的影响进行了表征,但HPVint与HNSCC的临床结果之间的确切关系仍然不清楚.
研究的目的:
- 研究HPVint对人类和HPV基因表达的影响.
- 确定HPVint与临床结果之间的关联,包括HNSCC中复发和整体存活率.
- 为了确定潜在的生物标志物风险分层和针对性治疗HPV相关的HNSCC.
主要方法:
- 从261个HNSCCRNA-seq样本和102个DNAHPVint事件在五个队伍的HPVint事件的分析.
- 调查HPVint对基因表达和临床结果 (复发,整体存活率) 的影响.
- 使用HPVRNA特征,如E1*整合和HPV基因表达比率 (HGER) 的HPVint阳性参与者的分层.
主要成果:
- 鉴定了一种与复发性HPVint位置和基因表达改变相关的致癌基因网络,突出NR4A2,CD274,CCER1,CAMK和KLF家族.
- 发现拼接的HPV-人类融合转录 (E1*整合) 和HPV基因表达比率 (HGER) 可以根据风险对患者进行分层.
- 证明特定的HPVRNA特征与HPVint阳性HNSCC患者子组中较差的临床结果相关.
结论:
- 专注于RNA揭示了对HPVint致癌机制的新见解,澄清了它与侵略性表型的关联.
- 这项研究提供了潜在的基于RNA的生物标志物 (E1*集成,HGER) 来推进HPV相关HNSCC的精密瘤学.
- 新发现的基因具有反复的整合事件,代表了新型治疗策略的潜在目标.
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