单细胞激活屏幕识别了具有区域分辨率的肝成熟调节器.

科学领域:

• 发育生物学是发展生物学.
• 肝病学 肝病学是一种肝病学.
• 基因调节 基因调节

背景情况:

• 胚胎肝细胞的成熟涉及复杂的基因调节网络 (GRN) 的重新连接.
• 在体外获得完全成熟的功能性肝细胞仍然是一个重大挑战.
• 晚期肝脏发育的关键转录调节者还没有得到很好的定义.

研究的目的:

• 为了确定控制胚胎肝细胞晚期成熟的新型转录调节剂.
• 了解肝脏发育过程中GRN重新连接的机制.
• 为了增强体外衍生肝细胞的功能.

主要方法:

• 为小鼠胚胎肝细胞创建一个发育参考地图.
• 使用dCas9激活屏幕与单细胞转录组学相结合.
• 排列了晚期发病的转录调节器对肝细胞基因表达的影响.

主要成果:

• 鉴定Nr1i3作为一个强大的诱导器的周围中心代谢基因.
• 确定了Nfix作为胚胎和周边基因签名的关键抑制剂.
• 补充肝脏区域信号与Nr1i3和Nfix增强的中心周代谢基因表达.

结论:

• Nr1i3和Nfix在编排肝细胞成熟和区分方面发挥着至关重要的作用.
• 使用已识别的调节剂的微环境向方法可以改善体外细胞功能.
• 该研究提供了对器官成熟调节机制和细胞治疗策略的见解.