通过利用多原子数据集成和多种药物重定向数据库来识别治疗阿片类药物使用障碍的化合物
Jeran K Stratford1, Megan Ulmer Carnes1, Caryn Willis1
1GenOmics and Applied Public Health, RTI International, Research Triangle Park, NC, USA.
研究人员开发了一个框架,以识别FDA批准的药物用于阿片类药物使用障碍 (OUD) 重新利用. 通过整合遗传和药物数据,他们发现了许多针对OUD相关基因的候选药物,加速了药物发现.
科学领域:
- 药物基因组学 药物基因组学
- 神经科学是一个神经科学.
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 遗传研究已经确定了与阿片类药物使用障碍 (OUD) 生物学相关的基因.
- 利用这些遗传发现用于药物重定向是具有挑战性的,因为数据集成的复杂性.
研究的目的:
- 开发和实施一个框架,系统地整合多组数据和药物数据库,以确定用于OUD重用药物治疗的药物疗法.
- 为了识别FDA批准的药物,针对与OUD生物学相关的基因.
主要方法:
- 从全基因组关联研究 (GWAS) 和人类大脑组织差异基因表达 (DGE) 分析的综合结果.
- 进行了网络分析,以确定蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 的子网络,这些子网络为GWAS风险位置进行了丰富.
- 查询药物数据库 (Pharos,开放目标,TTD,DrugBank) 查询药物的临床状态和目标选择性.
- 开发了四种选择策略,以整合跨经济和药物查询结果.
主要成果:
- 从GWAS中确定了3个基因,从DGE分析中确定了335个基因 (FDR q <0.05).
- 网络分析检测到22个富含PPI网络中的70个基因.
- 该框架确定了72至676个基因和110至683种针对这些基因的药物.
- 在过后,2至329种FDA批准的药物仍然是OUD重新用途的候选药物.
结论:
- 开发的框架允许对OUD相关基因进行高通量查询,并通过整合各种生物证据来确定候选药物治疗方法.
- 这种方法成功地确定了许多FDA批准的药物用于OUD重用,弥合了遗传发现和临床应用之间的差距.
- 该方法通过提供符合条件的化合物和支持证据的简要摘要,促进了高效的专家审查.
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