通过乙二和三酸与二甲利醇的血提取以及用于低分子量蛋白质组分析的组合

科学领域:

• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 生物化学 生化学
• 生物标志物发现发现

背景情况:

• 循环中的低分子量 (LMW) 蛋白质组部分含有潜在的诊断标记物.
• 目前基于质谱的等离子体LMW蛋白质组分析覆盖范围有限.
• 优化提取对于全面的LMW蛋白质组分析至关重要.

研究的目的:

• 为了提高等离子体LMW蛋白质组分析的覆盖范围和深度.
• 确定从血中提取LMW蛋白质的最佳提取条件.
• 促进新型基于血液的生物标志物的发现.

主要方法:

• 评估了各种度的乙二和三酸 (TCA) 用于LMW蛋白质提取.
• 研究了dithiothreitol (DTT) 对提取效率的影响.
• 采用高pH逆相分化和质谱仪,在三性消化后进行深入的蛋白质组分析.

主要成果:

• 不同的提取溶液 (60%,70%,80%,90%的乙二和10%的TCA有或没有DTT) 不同地提取LMW蛋白质.
• 使用60%和80%的乙二和10%的TCA (带有或没有DTT) 的优化提取使得全面分析成为可能.
• 鉴定了5638种来自于血LMW蛋白质组中的805种蛋白质的三性.

结论:

• 开发了一种更全面的血LMW蛋白质组分析方法.
• 优化的方法显著增加了已识别的蛋白质的数量.
• 预计这种方法将加强用于诊断目的的血液生物标志物的发现.