影响乳牛产前期和早期生存的基因组区域
M M Axford1, M Khansefid2, I M MacLeod2
1Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBioscience, Bundoora, Victoria 3083, Australia; School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Victoria 3083, Australia; DataGene Ltd., Bundoora, Victoria 3083, Australia.
Journal of dairy science
|November 22, 2025
概括
由于死产 (SB) 和断奶前死亡率 (PWM) 造成的乳牛犊损失是昂贵的. 这项研究确定了与这些特征相关的显著遗传区域和单种类型,揭示了近亲繁殖对乳牛幼早期生命生存的影响.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 乳制品科学 乳制品科学
- 生殖生物学 生殖生物学
背景情况:
- 牛犊的生存对于奶牛群的生产力和利能力至关重要.
- 死产 (SB) 和断奶前死亡率 (PWM) 显著影响农场经济和动物福利.
- 识别影响SB和PWM的遗传因素可以改善育种策略并减少损失.
研究的目的:
- 确定乳牛中与SB和PWM相关的基因组区域.
- 调查特定区域内生繁殖 (同胞性运行,ROH) 在生命早期死亡率中的作用.
- 为了发现影响小牛生存的潜在有害突变.
主要方法:
- 全基因组关联研究 (GWAS) 关于荷尔斯坦和泽西小牛的SB和PWM表型.
- 对11525只霍尔斯坦和1272只泽西小牛的全基因组序列进行基因型归算.
- Haplofinder 分析以检测与 SB 和 PWM 相关的不利的平分类型和同卵性 (ROH) 运行.
主要成果:
- GWAS在多个基因组区域中发现了198个显著变异,表明SB和PWM是多基因特征.
- 最大效果大小表明增加了SB (高达20%) 和PWM (高达4%).
- 当同卵性被确定时,有243个与增加的SB和PWM相关的单双类型;4个含有显著的GWAS变异,包括在MSTN基因附近.
结论:
- 遗传因素和特定区域的近亲繁殖导致乳牛犊死产和断奶前死亡率.
- 确定的基因组区域和基因 (例如,MKS1,MYH3,FHIT,THSD7A) 提供了改善小牛生存的目标.
- 这些发现提高了对乳制品种群中早期生命存活率的遗传控制的理解.
