精细映射,候选基因识别和果皮耐药性基因Rvi2的标志物开发

科学领域:

• 植物遗传学和育种.
• 分子生物学分子生物学
• 农业科学 农业科学

背景情况:

• 由Venturia inaequalis引起的果,对全球果产量构成重大威胁.
• 由于病原体的快速演变和环境问题,对杀菌剂的依赖是不可持续的.
• 以前的繁殖努力通过逆交引入了新的抗性基因,如Rvi2,通过逆交.

研究的目的:

• 为了剖析果中Rvi2皮耐药部位的遗传基础.
• 为了确定负责Rvi2-介导耐药性的特定遗传元素.
• 开发一种分子标记物,用于高效的标记物辅助抗性选择.

主要方法:

• 产生了复原型阶段和牛津纳米孔基因组组合的耐药果加入.
• 使用分离的"皇家加拉"×TSR34T15种群进行了细分映射.
• 识别和表征结构变异 (SVs),包括长终端重复 (LTR) 逆转移体.

主要成果:

• 精细映射将Rvi2位点限制在一个狭窄的基因组间隔.
• 一个10,041bp的LTR逆转移素插入,一个结构变体 (SV) 被确定并与Rvi2.2有很强的联系.
• 在LTR中,一个FPPS基因与一个候选防御基因相邻,这表明它在抵抗中起着调节性作用.

结论:

• 已识别的LTR插入是与Rvi2抗性相关的关键结构变体.
• 这种SV,可能调节相邻的防御基因,为繁殖提供了一个新的目标.
• 从这种SV中获得的经过验证的标记器可以实现高效的标记器辅助选择,简化了耐皮果品种的发展.