从人类精子单分子测序中直接识别新的移动元素插入
Stacy Li1,2, Kenneth Aston3, Joseph G Gleeson4
1Department of Integrative Biology, University of California - Berkeley.
bioRxiv : the preprint server for biology
|November 24, 2025
概括
我们直接测序精子配体,以识别新的移动元素插入 (MEI),而无需进行家族研究. 父亲的年龄显著增加了Alu的逆转换率,揭示了与年龄相关的突变增加.
科学领域:
- 人类遗传学 人类遗传学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 移动元素插入 (MEI) 有助于人类遗传变异.
- 鉴别新的MEI是具有挑战性的,因为序列的限制.
研究的目的:
- 为了直接识别人体雌激素体中的de novo逆转换事件.
- 在没有家族推断的情况下,描述de novo MEI的发病率和特性.
- 调查父亲年龄对逆转移活性的影响.
主要方法:
- 使用PacBio的长读技术,直接测序单个精子配子.
- 开发一种自我调整策略,以高精度检测新的MEI.
- 在14名年龄在28-62岁的捐赠者中分析了51个de novo Alu插入.
主要成果:
- 确定了51个de novo Alu插入,显示个人之间逆转换率的7倍变化.
- 显示Alu活动随着父亲年龄的显著增加 (0.003插入/双胞胎/年).
- 观察到活跃的Alu元素属于年轻子家族 (AluYa5,AluYb8) 并显示针对目标的反转录签名.
结论:
- 直接配体测序是研究生殖系突变过程的强大方法.
- 父亲年龄是男性生殖系中新生逆转移的重要决定因素.
- 该研究验证了直接观察和人口方法来估计新的MEI率.


