MERFISH +是一个大型的多omics空间技术,可以解决3D人类发育中的心脏的分子全息图

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 细胞生物学 细胞生物学
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 空间转录学技术对于理解组织组织至关重要.
• 现有的方法在基因覆盖,多式联络分析和可扩展性方面存在局限性.
• 多重错误强大的光现场混合 (MERFISH) 是该领域的一个关键技术.

研究的目的:

• 为了介绍MERFISH+,这是MERFISH的高级版本,具有改进的功能.
• 在复杂组织中展示MERFISH+用于高分辨率的3D空间多态.
• 重建一个关于人类心脏发育的全面3D地图.

主要方法:

• MERFISH+集成化学探头在水凝中固定,与微流体和显微镜进行强大的杂交.
• 该平台支持在厘米尺度组织样本中重复的杂交周期.
• 使用生成集成框架 (Spateo-VI) 来协调转录组和染色质数据.

主要成果:

• 通过MERFISH+,可以同时量化超过1800个基因.
• 在发育人类心脏中的染色质位点和表观遗传学标记的3D组织得到了解决.
• 发育中的人类心脏的3D空间分辨率的多原子地图集,包括34个人群中的310万个细胞,以亚细胞分辨率重建.
• 该图谱允许对3D细胞社区和转录梯度进行表征.

结论:

• MERFISH+提供了一个强大的,大格式的空间多主题平台.
• 这项技术使得在亚细胞水平上实现高分辨率的基因表达映射.
• MERFISH+促进了3D器官中细胞组织的详细表征.