RUNX1T1-HDAC重新编程HOX代码信号驱动一个可向的泛癌谱系可塑性

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 癌症生物学 癌症生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 血统可塑性是癌症治疗耐药性和进展的关键机制.
• 鉴定塑性癌症亚型是具有挑战性的,因为缺乏泛癌标志物.
• 家庭盒 (HOX) 基因通过特定的表达模式 (HOX 代码) 建立细胞身份.

研究的目的:

• 为了识别血统可塑性的泛癌生物标志物.
• 调查HOX基因表达在癌症血统身份和可塑性中的作用.
• 发现与血统可塑性相关的新型治疗漏洞.

主要方法:

• 分析了多omics数据,包括来自114种癌症类型的80,000多个RNA-seq样本的39个HOX基因.
• 差异基因表达分析以识别可塑性标记物.
• 使用从临床前和临床队列中的大量和单细胞RNA-seq进行验证.
• 以人工智能为基础的建模,以识别蛋白质相互作用和调节复合体.
• 在前列腺癌模型中的功能研究.
• 药理上抑制了组织素脱乙酶 (HDAC).

主要成果:

• 霍克斯代码表达力强大地代表癌细胞系谱,并识别前列腺癌,肺癌和急性髓性白血病 (AML) 的新型系谱-塑料亚型.
• RUNX1T1被确定为一种新的,一致的泛癌性塑性标记物,在塑性亚型中升高,与HOX代码相关.
• RUNX1T1在功能上被验证为前列腺癌中血统塑料程序的必需品.
• 人工智能建模显示,RUNX1T1与NCOR/HDAC形成共抑制器复合体,调节HOX代码和可塑性.
• 药理学HDAC抑制可以选择性地抑制塑性癌细胞的生长.

结论:

• 异位RUNX1T1作为泛癌生物标志物和血统可塑性的调解者.
• RUNX1T1-HDAC复合体代表了治疗血统塑性癌症的可用药物标.
• 针对HDACs提供了一种针对塑性癌症亚型的新疗法策略.