跨祖先多基因风险评分提高了多民族队列中阿尔茨海默病风险预测
Meri Okorie1,2,3,4, Caroline Jonson5,3,6,7,8, Alexis P Oddi5,3
1UCSF School of Pharmacy and the UCSF School of Medicine, University of California, San Francisco, San Francisco, USA.
开发交叉祖先多基因风险评分 (PRS) 可以改善不同人群中阿尔茨海默病 (AD) 的预测. 这项研究强调了需要包括性的遗传数据,以提高AD-PRS跨祖先的可传输性.
科学领域:
- 遗传学 遗传学是一种遗传学.
- 神经科学是一个神经科学.
- 人口健康 人口健康
背景情况:
- 全基因组关联研究 (GWAS) 已经确定了80多个阿尔茨海默病 (AD) 的遗传基因位点.
- 多基因风险评分 (PRS) 是从GWAS数据开发出来的,但它们的预测准确性在不同人群中是有限的.
- 评估单个,多个和跨祖先的AD-PRS模型对于改善不同祖先群体的预测至关重要.
研究的目的:
- 评估各种阿尔茨海默病多基因风险评分 (AD-PRS) 模型的预测准确度.
- 为了比较单个,多个和跨祖先的AD-PRS模型在不同人群中的性能.
- 调查包容性遗传数据集的实用性,以提高AD-PRS的可运输性.
主要方法:
- 利用了来自欧洲,非洲,美洲印第安人和东亚人口的AD GWAS总结统计数据.
- 使用不同的祖先模型,为每个目标人群构建了AD-PRS.
- 使用概率比率,R2 (R2) 和曲线下的面积 (AUC) 评估模型性能.
主要成果:
- 交叉祖先贝叶斯式PRS模型在非欧洲人群中显示了最高的预测性能.
- 这种模式与较差的认知功能和较低的CSF Aβ42水平显著相关.
- 交叉祖先模型还与严重的Aβ和tau神经病理负担以及临床AD潜伏变量相关.
结论:
- 跨祖先的PRS模型在非欧洲祖先中显示出卓越的预测能力.
- 包括性遗传数据集对于开发更普遍适用的AD-PRS至关重要.
- 在多祖先种群中增强AD-PRS的可传输性需要包容性数据和先进的建模.
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