通过生物信息学分析和实验研究在EV71-感染细胞中识别潜在的关键铁亡相关基因
Yuhan Zhang1, Meishan Zhou1, Liu Yang1
1Department of Immunology, School of Medicine, Jianghan University, Wuhan, 430056, Hubei, China.
Current microbiology
|November 25, 2025
概括
肠道病毒71 (EV71) 感染会改变与铁亡相关的基因,影响细胞活力. 这项研究确定了关键的基因,转录因子和参与EV71诱导的铁亡的微RNA,表明了潜在的治疗标.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 细胞死亡研究 细胞死亡研究
背景情况:
- 铁,一种依赖于铁的细胞死亡,涉及脂质过氧化,并与病毒感染有关.
- 肠道病毒71 (EV71) 导致严重的手足口腔疾病,但其与铁亡的联系尚不清楚.
- 了解EV71感染中的铁亡对于开发新的治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 为了研究铁死在肠道病毒71 (EV71) 感染中的作用.
- 在EV71感染细胞中识别差异表达的铁亡相关基因 (FR-DEG) 和调控因子.
- 探索将铁死与EV71病变发生联系起来的潜在机制.
主要方法:
- 从基因表达综合 (GEO) 下载并分析了EV71感染样本的微阵列数据 (GSE71673).
- 从FerrDB中检索了与铁亡相关的基因 (FRG),并确定了差异表达的FRG (FR-DEGs).
- 进行了基因本体学 (GO),基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 丰富和蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络分析.
- 在EV71-感染的U87细胞中验证了枢纽基因,转录因子和微RNA.
主要成果:
- 在EV71感染细胞中鉴定出69个差异表达的铁亡相关基因 (FR-DEGs).
- 发现了与miRNA转录,蛋白质结合和癌症途径的显著关联.
- 验证了五个枢纽基因 (IL-6,JUN,CXCL8,FGF2,TGFB1),六个转录因子和三个调节基因表达的微RNA.
- 观察到细胞GSH和GPX4表达减少,ROS产量增加,EV71感染细胞的细胞活力下降.
结论:
- EV71感染诱导了与铁亡相关的基因的显著转录重编程.
- 在枢纽基因表达中确定了特定的转录因子和microRNA的关键调控作用.
- 这些发现表明铁死在EV71感染中起着作用,这需要进一步的实验验证.
