对文本挖掘应用程序的评估,用于快速分析自由文本野生动物尸检报告
Stefan Saverimuttu1,2, Kate McInnes3, Kristin Warren4
1New Zealand Center for Conservation Medicine, Auckland Zoo, Auckland, New Zealand.
PloS one
|November 25, 2025
概括
一个文本挖掘工具,DEE,有效地提取野生动物尸检数据,以实现保护和One Health目标. 它的性能随着搜索术语的变化而变化,在诸如外部油等发现方面表现出色,展示了数据分析的潜力.
科学领域:
- 兽医病理学 兽医病理学
- 野生动物健康 野生动物健康
- 保护科学 保护科学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 野生动物尸体解剖报告包含了保护和One Health的宝贵数据.
- 手动审查自由文本解剖数据是耗时且低效的.
- 自动化文本挖掘工具可以改善从临床记录中提取数据.
研究的目的:
- 评估DEE (描述,探索,检查) 文本挖掘应用程序,以从野生动物尸检报告中提取见解.
- 与手册审查相比,评估DEE在量化特定临床病理发现方面的准确性.
- 在野生动物病理学数据中识别影响文本挖掘性能的因素.
主要方法:
- 一项涉及九名兽医专业人员的试点研究测试了DEE应用程序.
- 用DEE量化了两种物种数据集中的四个临床病理发现 (外部油化,创伤,二牙炎,饥饿).
- 计算性能指标 (回忆,精度,F1得分) 并与手动审查进行比较.
主要成果:
- DEE证明了时间效率高的数据检索,平均F1分数从0.63到0.93.9不等.
- 性能受搜索术语选择和用于描述发现的术语变化的影响.
- 具有有限的术语差异的发现,例如外部油,显示出更高的性能和一致性.
结论:
- 基于规则的文本挖掘方法,如DEE,在获得野生动物数据的洞察力方面具有实用性.
- 为了在这个领域更广泛地应用文本挖掘,需要改进以捕捉术语差异.
- DEE提供了一种有希望的,节省时间的方法来分析野生动物尸检数据,支持保护工作.
