在酸性矿井排水沉积物中,CPR和DPANN病毒的生物地理和宿主相互作用

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 病毒学 病毒学
• 环境科学 环境科学

背景情况:

• CPR和DPANN超级家族在无氧环境中分布在全球.
• 与这些超级族群相关的病毒群落,特别是在极端息地,在很大程度上没有特征.

研究的目的:

• 研究感染CPR和DPANN生物体的病毒的生物地理和生态作用.
• 了解在酸性矿井排水 (AMD) 环境中的病毒社区组合和宿主病毒相互作用.

主要方法:

• 来自AMD沉积物的病毒基因组的元基因组和元转录组分析.
• 生物信息分析以确定病毒组合,病毒生活方式和基因功能.
• 网络分析以推断宿主病毒相互作用和共生关系.

主要成果:

• 从中国的AMD沉积物中恢复了各种CPR和DPANN病毒基因组.
• 确定性过程在很大程度上影响了CPR和DPANN病毒组合和分布.
• 无论是CPR病毒还是DPANN病毒,都可能采用Piggyback-the-winner策略,CPR病毒在特定条件下显示 lysis 的增加.
• 表达的病毒基因表明它们在补充宿主新陈代谢中的作用,在复制和翻译方面具有不同的功能.
• 有证据表明,共生宿主可能会对这些病毒提供抗病毒防御.

结论:

• CPR和DPANN病毒表现出明显的生物地理模式,由决定性过程驱动.
• 在AMD中,病毒与宿主之间的相互作用是复杂的,涉及PtW和潜在宿主提供的抗病毒防御等策略.
• 这些发现揭示了病毒,CPR/DPANN微生物及其在极端环境中的共生伙伴之间的复杂生态相互作用.