QuNex食谱:可执行,人类可读的工作流程,用于可重复的神经成像研究

科学领域:

• 神经成像是一种神经成像.
• 计算神经科学是一种神经科学.
• 数据科学数据科学数据科学

背景情况:

• 神经成像数据的预处理和分析是复杂的,需要多种工具和参数调整.
• 目前的方法往往缺乏足够的细节来实现完全的透明度和可重复性.
• 这种复杂性阻碍了神经成像工作流程的共享和复制.

研究的目的:

• 介绍QuNex配方,定义和执行完整的神经成像工作流程的框架.
• 提高神经成像数据处理中的透明度,可复制性和标准化.
• 为了促进各种工具和自定义脚本在一个统一的平台内无集成.

主要方法:

• 开发了QuNex配方作为定量神经成像环境和工具箱 (QuNex) 的综合功能.
• 配方定义和执行端到端的神经成像工作流程,以机器和人类可读的格式.
• 该框架捕捉了所有处理步骤和参数设置,以获得完整的文档.

主要成果:

• QuNex配方使神经成像工作流程的透明,机器和人类可读的定义成为可能.
• 该框架允许无集成QuNex命令,自定义脚本和外部工具.
• 分享QuNex版本,配方文件和数据可以通过一个命令复制研究.

结论:

• QuNex配方标准化了工作流程规范,并提高了神经成像研究的透明度.
• 这一框架有助于复杂的神经成像分析的可复制共享.
• 配方促进神经成像社区内最佳实践和可复制方法的开放交流.