基于CeRNA网络的FGF14-AS2/MPP2轴作为结直肠癌的预后生物标志物的鉴定
Rongrong Zhou1,2, Zhineng Zeng1, Ying Xu1
1Department of Clinical Laboratory, The First Affiliated Hospital of Guilin Medical University, Guilin, Guangxi, China.
Discover oncology
|November 26, 2025
概括
通过识别新的生物标志物,可以改善结肠直肠癌 (CRC) 的预后. 这项研究发现,FGF14-AS2和MPP2在CRC下调,可以作为患者结果的潜在预后生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 构成了全球严重的健康负担.
- 竞争性内源性RNA (ceRNA) 网络与癌症的发展有关.
- ceRNA网络在CRC诊断和机制中的作用需要进一步研究.
研究的目的:
- 探索ceRNA网络在结直肠癌诊断中的潜力.
- 为了确定CRC的新型预后生物标志物.
- 为CRC患者的预测结果开发一个预测模型.
主要方法:
- 利用TCGA和GEO数据库进行基因表达和临床数据.
- 使用生物信息学工具构建了一个ceRNA网络和蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 网络.
- 通过考克斯和卡普兰-梅尔分析确定了枢纽基因和关键预后基因.
- 开发并验证了一个使用拉索回归和ROC分析的预后模型.
- 使用Cellminer数据库评估药物敏感性.
主要成果:
- 确定了一个包括lncRNAs,miRNAs和mRNAs在内的全面的ceRNA网络.
- 发现MPP2和FGF14-AS2是与CRC预后相关的下调基因.
- 开发了一种具有中等预测能力的预后模型,包括N阶段,T阶段和FGF14-AS2表达.
- 在FGF14-AS2,MPP2和特定化疗剂之间发现了相关性.
结论:
- 在结直肠癌中,FGF14-AS2和MPP2的调控下降,并且作为预后生物标志物具有前景.
- 开发的预后模型为CRC结果提供了适度的预测价值.
- 这些发现有助于理解CRC中的ceRNA网络,并可能有助于临床决策.
