小小的吸水体结合到LptDE外膜脂多聚糖体转孔的开放状态
Emily Dunbar1, Robert Clark2, Arnaud Baslé1
1Biosciences Institute, The Medical School, Newcastle University, Newcastle upon Tyne NE2 4HH, United Kingdom.
菌体受体结合蛋白 (RBPs) 与细菌外膜脂聚糖转位体LptDE相互作用. 这项研究揭示了意想不到的开放LptDE状态和超级感染排除机制,影响了菌体治疗策略.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 结构生物学 结构生物学
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 菌体 (菌体) 是感染细菌的病毒,并被探索作为抗生素对抗耐药菌株的替代品.
- 菌体与细菌之间的相互作用由受体结合蛋白 (RBPs) 介导,这些蛋白质识别特定的细菌表面受体.
- 脂聚糖转位子LptDE是一种新发现的受体,适用于某些体,对外膜蛋白质的运输至关重要.
研究的目的:
- 阐明菌体Oekolampad与LptDE受体相互作用的结构基础.
- 通过菌素蛋白Rtp45.5研究超级感染排除的机制.
- 识别赋予对菌体Oekolampad耐药性的细菌突变,并了解它们对受体-LptDE相互作用的影响.
主要方法:
- 低温电子显微镜 (cryo-EM) 用于确定与LptDE结合的菌体RBP的结构.
- 对LptDE与菌蛋白Rtp45.5复合体中的结构分析.
- 对自发的菌素耐药 *Escherichia coli* 突变的遗传分析.
- SDS-EDTA灵敏度测试用于评估外膜完整性.
主要成果:
- 低温EM显示,Oekolampad RBP与LptDE的新型开放状态结合,其中β链占据侧门.
- 与LptDE结合的Rtp45的结构阐明了一种超级感染排除机制,涉及硬质障碍和构造变化.
- 确定了LptD中赋予Oekolampad耐药性的突变,在体外消除了RBP-LptDE相互作用,而不损害外膜完整性.
结论:
- 在Oekolampad RBP中,LptDE用于受体结合的前所未知的开放形状被利用.
- 体蛋白Rtp45使用固体碰撞来抑制RBP结合,这是一种新的超级感染排除策略.
- 虽然LptDE介导的菌体耐药性是可能的,但突变表明,由于受体功能保留,通过LptDE引导菌体可能具有挑战性.
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