数字聚合物测序的加速,简化和潜在并行化,通过将合式质谱与离子移动性合在一起
Isaure Sergent1, Georgette Obeid2, Thibault Schutz2
1Aix Marseille Université, CNRS, Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Marseille, France.
研究人员开发了一种更快,自动化的方法,使用质谱测量测序数字聚合物. 这种新的工作流允许在单次运行中高效地从块截断的聚二中读取数据.
科学领域:
- 聚合物化学 聚合物化学
- 分析化学 分析化学
- 质谱测量质量谱测量
背景情况:
- 数字聚合物为高密度数据存储提供了一个平台.
- 目前使用串联质谱法 (MS) 测序数字聚合物的方法很慢,不自动化.
- 之前的工作通过使用块截断的聚二体实现了最多33个字节的完整序列覆盖.
研究的目的:
- 开发一个快速,自动化,单次运行的工作流程来测序数字聚合物.
- 提高从数字聚合物读取基于质谱的数据的效率和适用性.
主要方法:
- 建立了一个新的气相自下而上的工作流.
- 优化了两个激活阶段的多维合与离子运动谱学 (IMS).
- 使用矩阵辅助激光脱吸/电离 (MALDI) 进行分析.
主要成果:
- 新的工作流允许在单次运行中生产,分离和对所有子序列进行测序.
- 离子移动性光谱学提供了基于可预测的聚合物块移动性变异的预测序列分离.
- 通过标签选择和IMS分辨率,成功识别和测序聚合物块.
结论:
- 开发的方法显著提高了数字聚合物测序的速度和自动化.
- 这种方法为基于图像的数字聚合物数据的自动阅读铺平了道路.
- 优化的工作流代表了基于质谱的数据存储和检索的突破.
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