在B73 EMS突变种群中通过eBSRmap (简单批量分离RNA映射) 进行测序测绘
Yang Cui1,2, Jing Yang3, Haiming Zhao4
1Frontiers Science Center for Molecular Design Breeding (MOE), State Key Laboratory of Maize Bio-Breeding, Key Laboratory of Genome Editing Research and Application, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, National Maize Improvement Center, College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China.
一种新的EBSRmap方法简化了玉米核特征的基因克隆. 这种技术有效地识别大型突变种群中的候选基因,帮助玉米繁殖和遗传改进.
科学领域:
- 植物遗传学 植物遗传学
- 农业科学 农业科学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 玉米是食品,料和工业应用的重要作物.
- 玉米核的特征是整体玉米产量的关键决定因素.
- 了解核特征的遗传基础对于作物改进至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证EBSRmap方法,用于高效地克隆玉米中的基因.
- 为了简化识别控制内核特征的基因的过程.
- 为了促进玉米突变种群的大规模遗传分析.
主要方法:
- 一个玉米乙基甲硫酸盐 (EMS) 诱导突变种群的构建.
- 聚合突变物和野生类型样本的RNA测序 (RNA-seq).
- 用于基因映射的单核酸多态 (SNP) 标记物的识别.
主要成果:
- 该方法确定了20个内核特征突变的候选基因.
- 成功地绘制了12个基因,其中8个通过共同分离分析 (40%的成功率) 得到证实.
- 鉴定的基因含有突变 (错误,停止获得) 影响内核表型 (例如,小,缩小,有缺陷).
结论:
- eBSRmap提供了一种快速且具有成本效益的方法,用于在大型突变种群中的基因映射.
- 该方法有助于理解与玉米核发育相关的基因功能.
- 识别的候选基因对未来的功能验证和玉米育种计划有价值.
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