在黎巴嫩南部对抗卡巴耐药格拉姆阴性细菌的分子流行病学监测
Anwar Al Souheil1,2, Hadi Hussein2,3,4, Ziad Jabbour2,3,4
1Department of Biological Sciences, Faculty of Science, Beirut Arab University, Beirut 1107 2809, Lebanon.
Antibiotics (Basel, Switzerland)
|November 27, 2025
概括
耐卡巴胺的格拉姆阴性细菌是黎巴嫩南部的重大威胁,发现了大量抗药性菌株的高率. 基因组监测对于追踪耐药性和防止进一步传播至关重要.
科学领域:
- 医学微生物学 医学微生物学
- 基因组流行病学 基因组流行病学
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 耐卡巴胺的グラム阴性细菌 (CR-GNB) 构成了日益严重的全球健康威胁,增加了患者的发病率和死亡率.
- 对于黎巴嫩南部的CR-GNB存在有限的分子流行病学数据,这阻碍了有效的监测和控制.
- 这项研究提供了黎巴嫩南部CR-GNB的第一个分子特征.
研究的目的:
- 在黎巴嫩南部进行CR-GNB的第一个分子流行病学分析.
- 确定主要的CR-GNB物种及其抗微生物耐药性概况.
- 调查耐药性的遗传基础,包括AMR基因和等离子体载体,并评估传播模式.
主要方法:
- 来自黎巴嫩南部的ICU患者的131个CR-GNB分离物的全基因组测序 (WGS).
- 生物信息分析用于物种识别,多部位序列类型 (MLST),抗菌素耐药性 (AMR) 基因分析和等离子体分析.
- 遗传学分析以确定孤立的相关性和传播模式.
主要成果:
- 鉴定出的主要CR-GNB物种是* Pseudomonas* spp. 和大肠杆菌 (每种为26.7%),其次是肺炎菌 (Klebsiella pneumoniae) (19.8%) 和宝曼菌 (Acinetobacter baumannii) (17.6%).
- 高比例的分离物具有广泛的耐药性 (XDR, 40.5%) 或多重耐药性 (MDR, 52.7%).
- 常见的AMR基因包括*bla*OXA类型 (65%) 和*bla*NDM-5 (27%). 塑分析显示,96%的携带塑的分离物中存在Inc-家族塑. 遗传学分析表明,在多个医疗机构中广泛传播.
结论:
- 具有多种AMR基因和等离子体的CR-GNB的高患病率突显了黎巴嫩南部的一个关键的公共卫生问题.
- 基于下一代测序 (NGS) 的基因组监测迫切需要监测耐药性趋势并指导感染控制.
- 实施基因组监测将有助于追踪耐药性,识别疫情,并减轻CR-GNB的传播.
