单细胞多组体分析揭示了与高风险B-ALL在强化化疗后复发相关的细胞亚群

科学领域:

• 儿科瘤学 儿科瘤学
• 血液学 血液学 血液学
• 基因组学就是基因组学.
• 免疫学 免疫学 免疫学

背景情况:

• 急性淋巴细胞白血病 (ALL) 是一种常见的儿童癌症.
• B细胞ALL (B-ALL) 占儿科ALL病例的85%.
• 治疗耐药性和复发仍然是高风险B-ALL患者面临的重大挑战.

研究的目的:

• 调查儿童高风险B-ALL治疗耐药性的基础分子机制.
• 为了识别与化学疗法后复发相关的不同的细胞亚群.
• 为开发针对B-ALL的向治疗提供见解.

主要方法:

• 对外围血液单核细胞 (PBMCs) 的综合单细胞多组体分析 (scRNA-seq和scATAC-seq).
• 在化疗后对儿科高风险B-ALL患者和健康对照者的分析.
• 生物信息管道用于细胞组成,染色质可访问性,基因本体学和拷贝数变异 (CNV) 分析.

主要成果:

• 非缓解组显示HSC/MPP和Pro-B细胞增加,具有更高的CNV水平.
• 在HSC/MPP和Pro-B细胞内确定了耐药子集群.
• 耐药的HSC/MPP细胞过度表达TCF4,EBF1,ERG,并被丰富在异种移植排斥和Notch信号通路中.
• 耐药的Pro-B细胞过度表达了RPS29,B2M,RPL41,并且在B细胞受体信号通路中得到了丰富.

结论:

• 显著的细胞亚群与儿科B-ALL治疗失败有关.
• 揭示了对治疗耐药性机制的分子见解.
• 这些发现可能有助于开发针对高风险B-ALL的新型向疗法.