在J-PDX图书馆中,用于患者衍生异种移植模型认证的全面DNA分析策略
Tomomi Yoshino1,2, Shigehiro Yagishita1,3, Mami Takahashi1,4
1Department of Pharmacology and Therapeutics, Fundamental Innovative Oncology Core, National Cancer Center Research Institute, 5-1-1 Tsukiji, Chuo-ku, Tokyo, 104-0045, Japan.
Scientific reports
|November 29, 2025
概括
本研究介绍了一种DNA分析策略,用于验证患者衍生异种移植模型的真实性. 单核酸多态分析提供可靠的质量控制,特别是在微卫星不稳定的瘤.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 遗传学 是一个
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 患者衍生异种移植 (PDX) 模型对于癌症研究和药物开发至关重要.
- 对PDX模型的有限身份验证方法对研究可重复性构成挑战.
- 确保PDX模型对其原始患者瘤的忠实性至关重要.
研究的目的:
- 为PDX模型质量控制制定和验证一个全面的DNA分析策略.
- 为了比较短串重复 (STR) 和单核酸多态 (SNP) 分析用于PDX认证的有效性.
- 为J-PDX图书馆建立一个强大的工作流程,提高其用于临床前研究的可靠性.
主要方法:
- 分析了325个PDX模型,使用STR和SNP分析技术.
- 评估患者样本与相应的PDX模型之间的一致率.
- 微卫星不稳定性 (MSI) 和异性损失 (LOH) 对一致性影响的评估.
主要成果:
- 与STR分析相比,SNP分析显示出更高的可靠性和更少的变化.
- 在325个PDX模型中,91.1%匹配,7.4%无法确定,1.5%不匹配.
- 无法确定的模型显示出明显更高的MSI,突显了SNP分析在具有挑战性的情况下的优势.
结论:
- 结合STR和SNP的DNA分析工作流程为PDX模型提供了高效和强大的质量控制.
- SNP分析对于验证PDX模型至关重要,特别是那些具有高MSI且STR分析可能失败的PDX模型.
- 这种经过验证的工作流提高了J-PDX图书馆的完整性,支持可靠的药物开发和癌症研究.
