Pleural mesothelioma 的多核,组织学和 scRNA-seq 分析揭示了与新型未承诺的分子表型相关的负面预后
David T Severson1, Samuel Freyaldenhoven2, Benjamin Wadowski2
1The Thoracic Surgery Oncology Laboratory and the International Mesothelioma Program (www.impmeso.org), Division of Thoracic Surgery and the Lung Center, Brigham and Women's Hospital, and Harvard Medical School, Boston, Massachusetts; Duke University Health System, Durham, North Carolina.
概括
这项研究揭示了双相性多层间皮瘤 (PM) 中一种新的恶性细胞状态,并确定了TGF-β和GAS6-AXL信号作为潜在的驱动因素. 预后生物标志物MEST和MSLN得到了验证,以改善患者分层.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 多基因组学研究已经根据组织学类型确定了多基因组 Pleural mesothelioma (PM) 中的预后分子子集:表皮状 (ePM),双相 (bPM) 和肉状 (sPM).
- 影响这些子集生存的潜在生物机制在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 调查PM中恶性细胞 (MC) 状态的潜在生物学.
- 确定候选驱动因素和预后生物标志物,以改善患者分层.
主要方法:
- 来自40名患者的93个样本的单细胞RNA测序 (scRNA-seq).
- 进行了大量的外体和RNA测序,光学基因组映射,空间转录和组织学分析.
- 推断的副本数变体被用来分析MC状态的克隆限制.
主要成果:
- 确定了一种新型的未承诺的MC状态,富含bPM瘤.
- TGF-β和GAS6-AXL信号通路被确定为MC状态的候选驱动器.
- 两个预后性MC状态免疫组织化学生物标志物MEST和MSLN得到了验证.
结论:
- 初级PM组织的多原子和scRNA-seq分析为MC状态提供了新的候选驱动因素.
- 新的生物标志物可以改善患者分层,并可能完善临床决策.
- 进一步的研究可能会揭示PM的新治疗策略.
