通过生物信息学分析识别与异常性肺纤维化和肉症相关的关键基因
Lanying Shen1, Zihan Yi2, Jiahao Liu2
1Department of Geriatric Medicine, Second Affiliated Hospital of Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, Zhejiang, China.
PloS one
|December 1, 2025
概括
细胞内膜网膜 (ER) 压力与异常性肺纤维化 (IPF) 和肉类有关. 这项研究确定了13个与两种疾病相关的ER压力相关交叉基因 (ERSRCGs),提供了潜在的诊断生物标志物和治疗点.
科学领域:
- 生物医学研究生物医学研究
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 异形性肺纤维化 (IPF) 和肉症是影响患者生活质量的衰弱性疾病.
- 细胞内膜网膜 (ER) 应激是一种细胞机制,涉及到IPF和肉类的进展.
- 研究ER压力相关交叉基因 (ERSRCGs) 对于了解这些疾病中的细胞功能障碍至关重要.
研究的目的:
- 为了识别ER与压力相关的交叉基因 (ERSRCGs) 参与IPF和萨尔科佩尼亚的病变发生.
- 探索与IPF和肉症中ERSRCGs相关的分子途径和生物过程.
- 使用已识别的ERSRCGs开发IPF和肉类的诊断模型.
主要方法:
- 差异基因表达和权重基因同表达网络分析 (WGCNA) 用于ERSRCG识别.
- 功能丰富分析 (KEGG,GO,GSVA,GSEA) 用于对相关途径进行分类.
- 最小绝对缩小和选择操作员 (LASSO) 回归用于诊断模型构建,CIBERSORT用于免疫透分析,GeneMANIA用于PPI网络构建.
主要成果:
- 确定了13个ERSRCG与肉症和IPF显著相关.
- 丰富分析显示,它参与了氨基酸和异生菌代谢途径.
- 拉索回归确定了关键基因 (例如,IPF的CTH,IDI1; sarcopenia的FOXO1,CTH) 和ERSRCGs与免疫细胞透之间的显著相关性.
结论:
- ERSRCGs代表了IPF和肉症的潜在诊断生物标志物和治疗点.
- 确定了关键的基因和途径,为萨尔科佩尼亚和IPF之间的分子相互联系提供了新的见解.
- 开发出的诊断模型可以增强这些疾病的早期发现和风险评估策略.
