一个超级增强器相关的铁灭签名预测了结肠癌中的生存和免疫微环境,基于生物信息学分析和实验验证
Luying Wan1,2, Jingyi Li1, Xianhe Xie1,2,3
1Department of Oncology, Molecular Oncology Research Institute, The First Affiliated Hospital of Fujian Medical University, Fuzhou, China.
IET systems biology
|December 1, 2025
概括
一种新的结肠癌特征识别了超强增强剂相关的铁灭基因 (SEFGs),预测了患者的预后和免疫微环境状态. 这种工具可以改善免疫疗法反应预测,并指导治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 癌症基因组学 癌症基因组学
- 免疫治疗是一种免疫疗法.
背景情况:
- 免疫疗法对许多结肠癌患者提供了有限的益处.
- 超增强剂 (SE) 网络和铁灭失调节与癌症有关,但它们在结肠癌中的联合作用尚不清楚.
研究的目的:
- 在结肠癌中研究超强增强器相关铁灭基因 (SEFGs) 的预后和免疫微环境影响.
- 开发结肠癌预后和免疫治疗反应的预测特征.
主要方法:
- 通过交叉SE关联基因和与铁生相关的基因识别SEFG.
- 在TCGA-COAD和GSE39582队列中使用LASSO Cox回归开发了一个8基因的预后特征.
- 使用临床名录和RNA-Seq分析验证了签名.
主要成果:
- 8基因的SEFG签名准确地预测了整体存活率 (C指数=0.813),并与晚期,特定的分子亚型,高瘤突变负担和微卫星不稳定性相关.
- 高风险患者的生存率降低和悖论性免疫表型,包括增加免疫检查点和降低免疫治疗响应.
- 抑制SE抑制了TRIB2,CAV1和ENO3等关键基因的下调,TRIB2具有显著的预后价值.
结论:
- 该SEFG签名为同时预测结肠癌预后和评估免疫微环境提供了一个新的工具.
- 这种签名可能有助于识别可能受益于免疫疗法或超强增强抑制剂的患者.
- 对SEFG的进一步研究可能会导致改善结肠癌管理策略.
