评估抗生素耐药性基因的变异和空间模式以及灌池水中的水质
Matthew D Stocker1, Alan Gutierrez2,3, Jaclyn E Smith2,3
1Collaborator, Formerly With United States Department of Agriculture, Environmental Microbial and Food Safety Laboratory, Agricultural Research Services, Beltsville, MD, 20705, USA.
这项研究发现,农场池灌水中的抗菌素耐药性 (AMR) 基因度显示出稳定的空间模式. 建议在岸边取样,以便在这些水体中有效监测AMR.
科学领域:
- 环境微生物学 环境微生物学
- 水质监测 水质监测
- 抗微生物耐药性 (AMR) 是一种
背景情况:
- 灌水是抗菌素耐药细菌的重要储存库,加剧了全球抗菌素耐药性危机.
- 了解像农场池这样的小型水体中的AMR分布至关重要,但目前有限.
- 在灌水中有效监测AMR的策略需要了解空间度模式.
研究的目的:
- 调查在灌池内的抗微生物耐药基因 (ARG) 度中存在稳定的空间模式.
- 确定这些空间模式是否可以为设计更高效的AMR监测程序提供信息.
- 为了确定最佳的采样地点,以表示镜片灌水中的平均ARG度.
主要方法:
- 从2023年6月到9月,在马里兰州灌池的20个地点,每两周收集一次水样.
- 使用数字PCR (dPCR) 量化特定ARG,tetA和blaCTX-M的度.
- 使用平均相对差异分析来检测ARG度的稳定空间模式.
主要成果:
- 观察到tetA度的显著空间变化,变化系数从97%到377%不等.
- 来自池边的样本始终显示,与内部站点相比,度更高.
- 检测到稳定的空间模式,发现ARG度与水温,电导率和pH负相关.
结论:
- 在灌池中存在ARG的稳定空间模式,使得有针对性的监测设计的开发成为可能.
- 采样策略应优先考虑银行位置,以捕捉高ARG水平,可能受到陆地活动和水文学的影响.
- 在池中任意采样是不够的;为了在灌水中准确评估AMR,需要明智地选择地点.
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