鼻子微生物群的大规模表征重新定义了金黄色葡萄球菌的殖民地位

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 人类微生物组研究研究
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 黄金葡萄球菌的鼻腔殖民在人类中很常见,具有不同的载体状态 (持久,间歇,非载体).
• 与肠道微生物群相比,人类鼻腔微生物群在S. aureus殖民中的作用不太清楚.
• 需要进行大规模的研究,确定与S. aureus携带相关的鼻腔微生物组合.

研究的目的:

• 在一大群个体中描述鼻腔微生物组.
• 为了研究鼻腔微生物组合和黄金葡萄球菌 (Staphylococcus aureus) 殖民状态之间的关系.
• 为了确定微生物生物标志物,预测持续的S. aureus鼻携带.

主要方法:

• 从CARRIAGE研究中分析了大约1100名来自CARRIAGE研究的个体的鼻子微生物组组成.
• 微生物组数据与金黄色葡萄球菌培养结果的整合.
• 应用机器学习算法来预测黄金色杆菌殖民持续性.

主要成果:

• 确定了七种不同的鼻微生物群社区状态类型 (CST).
• 持久的黄金菌携带者主要表现出黄金菌主导的CST.
• 非载体分布在其他CST中,间歇载体不是一个独立的状态.
• 持久的携带与较高的黄金色细菌丰富度和较低的特定开始性细菌丰富度有关.
• 机器学习模型准确地预测了持续的S. aureus殖民.

结论:

• 鼻子微生物组结构成不同的社区状态,受到Staphylococcus aureus殖民的显著影响.
• 持续的S. aureus殖民的特点是特定的微生物组特征,与非载体不同.
• 鼻子微生物组组成可以作为S. aureus殖民持续性的预测生物标志物.
• 特定的S. aureus血统表现出对鼻腔殖民的差异性适应.