解决还是结? 化学成像中的组织准备产生的光谱差异
Tianyi Zheng1, Wihan Adi1, Paul J Campagnola1
1Department of Biomedical Engineering, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|December 3, 2025
概括
组织制备显著影响中红外光谱化学成像 (MIRSI) 数据. 新鲜冷的组织保留的生物化学细节比甲固定,嵌组织,影响光谱分析和AI应用.
科学领域:
- 生物医学成像技术 生物医学成像技术
- 频谱学是一种光谱学.
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 中红外光谱化学成像 (MIRSI) 是一种无标签的技术,用于可视化组织生物化学.
- 了解MIRSI对样本准备的敏感性对于研究和药物开发中准确的数据解释至关重要.
研究的目的:
- 系统地比较新鲜冷 (FF) 和甲固定,嵌 (FFPE) 鼠和肝组织的光谱数据.
- 用各种光谱分析技术来描述MIRSI数据中的制备引起的差异.
主要方法:
- 基于量子级联激光 (QCL) 的MIRSI用于分析FF和FFPE老鼠和肝组织.
- 频谱数据处理包括统一的多重近似和投影 (UMAP),相关性矩阵和第二导数分析.
主要成果:
- 与FFPE组织相比,FF组织保留了更广泛的生物化学信号和先天化学成分.
- FFPE组织表现出减少的光谱多样性和吸收信号强度.
- 在FFPE样本中观察到一个独特的光谱带在1026厘米-1,表明甲素诱导的原交联.
结论:
- 组织制备方法大大改变了通过MIRSI获得的化学和形态信息.
- 密切考虑组织处理协议对于MIRSI工作流程至关重要,特别是那些涉及基于AI的光谱分析的工作流程.


