通过化学诱导的Split-APEX2近距离标记进行m6A-modified R-Loops的空间映射和交互原子造型
Meng-Die Zhu1, Hua-Qian Yin1, Zhong-Da He1
1State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, Frontiers Science Centre for New Organic Matter, Tianjin Key Laboratory of Biosensing and Molecular Recognition, Research Centre for Analytical Sciences, College of Chemistry, School of Medicine and Frontiers Science Centre for Cell Responses, Nankai University, Tianjin 300071, P. R. China.
Analytical chemistry
|December 3, 2025
概括
研究人员开发了m6A-R-loop近距离标记 (m6A-RLPL) 以可视化活细胞中的RNA修饰. 这种方法揭示了核细胞和病毒复制区中的m6A-R循环,识别了关键的蛋白质调节者.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 经N6-甲基氨酸 (m6A) 修改的R环对于表观遗传调节和基因组稳定至关重要.
- 了解它们在活细胞中的空间分布和蛋白质相互作用是具有挑战性的.
研究的目的:
- 开发一种新的近距离标记技术,用于在活细胞中空间分辨的m6A-R循环及其相互作用体的概况.
- 在宿主和病毒过程中调查m6A-R循环的动态和组织.
主要方法:
- 开发使用化学诱导的分割APEX2系统的m6A-R-循环近距离标签 (m6A-RLPL).
- 整合双目标识别 (R-loop 和 m6A) 与用于信号放大的 ABA-可诱导二分化.
- 在活细胞中应用,研究宿主m6A-R环和简单疹病毒 (HSV) 感染.
主要成果:
- 在正常条件下,m6A-RLPL揭示了宿主m6A-R环在核细胞中富含.
- 在晚期感染期间,观察到病毒m6A-R环在HSV复制区内的相隔颗粒中积累.
- 近距离蛋白质组学确定ZC3H4和CCDC124是这些病毒m6A-R循环结构的调节者,它们作为HSV晚期基因的转录部位.
结论:
- m6A-RLPL为研究生物系统中的m6A-R循环组织和相互作用提供了一个强大的,可泛化的工具.
- 这项研究阐明了m6A-R环在病毒基因表达中的作用,并确定了新的调节因素.
