为急性细胞排斥开发和验证支气管支气管洗基因组分类器

科学领域:

• 移植免疫学 移植免疫学
• 基因组医学是一种基因组医学.
• 肺部医学 肺部医学

背景情况:

• 急性细胞排斥 (ACR) 是肺移植后慢性肺异位功能障碍 (CLAD) 的主要危险因素.
• 目前的ACR诊断依赖于侵入性横支气管活检 (TBB).
• 之前的工作表明,支气管支气管洗细胞颗粒 (BAL-cp) 基因表达对于ACR检测是可行的.

研究的目的:

• 开发和验证一个基因组分类器,用于肺移植受体中ACR检测.
• 评估分类器预测CLAD风险的能力.
• 与TBB相比,建立一个不那么侵入性的诊断方法.

主要方法:

• 在806个BAL-cp上进行的RNA测序 (RNA-seq) 来自181名肺移植接受者.
• 一个31基因的随机森林模型使用训练和测试套件开发和优化.
• 在独立的单中心队列中验证;用于CLAD风险评估的Cox模型.

主要成果:

• 确定了62个ACR基因,突出显示了T细胞受体和CTLA4信号通路的改变.
• 基因组分类器在将ACR与稳定对照区分时取得了高准确度 (93.1%在培训中,82.1%在验证中).
• 晚期ACR (移植后≥90天) 与CLAD风险增加显著相关 (HR 2.52).

结论:

• 一个BAL-cp基因组分类器有效地识别了肺移植接受者的ACR.
• 这个分类符显示了预测CLAD风险的潜力.
• 基因组方法为ACR诊断提供了一个有希望的,不那么侵入性的TBB替代方案.