在分析和验证A解体和金属蛋白酶 (ADAM) 17基因错误变异:结构生物信息学研究
Abdelilah Mechnine1, Asmae Saih2, Lahcen Wakrim3
1Biotechnology and Biomolecule Engineering Research Team, Faculty of Sciences and Techniques of Tangier, Abdelmalek Essaâdi University, Ancienne Route de l'Aéroport, Km 10, Ziaten. BP:416, Tangier, 90030, Morocco.
JMIR bioinformatics and biotechnology
|December 4, 2025
概括
这项研究确定了可能影响蛋白质功能和SARS-CoV-2感染的高风险ADAM17变体. 这些发现有助于了解疾病风险和开发新疗法.
科学领域:
- 遗传学和生物信息学 遗传学和生物信息学
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- ADAM17或TNF-α转化酶,切割膜结合的TNF-α,对于免疫和炎症反应至关重要.
- 在ADAM17中的遗传变异与SARS-CoV-2感染易感性和严重性有关.
研究的目的:
- 识别有害的ADAM17误解变体,影响蛋白质的稳定性,结构和功能.
- 评估可能参与SARS-CoV-2感染的特定ADAM17变异.
主要方法:
- 在ADAM17中对12,042个单核酸多态 (SNPs) 的生物信息分析.
- 使用了多种预测工具 (SIFT,PolyPhen2.0,PROVEAN,PANTHER,SNP&GO,PhD-SNP,突变评估器,SNAP2,MUpro,I-Mutant,iStable,InterPro,Sparks-x,PROCHECK,PyMol,Project HOPE,ConSurf,SWISS-MODEL) 进行预测,并使用了多种预测工具.
主要成果:
- 七个非同义的SNP (P556L,G550D,V483A,G479E,G349E,T339P,D232E) 被预测为具有高风险的致病性,可能破坏ADAM17功能.
- 在保护区域的四种错误变种 (Q658H,D657G,D654N,F652L) 与SARS-CoV-2感染有关,并预测是有害的.
结论:
- 预计特定的ADAM17误解变体具有高度致病性,影响蛋白质的稳定性和功能.
- 这些变异可能有助于SARS-CoV-2的发病,为临床相关性,早期诊断和治疗策略提供了见解.
