使用时空空间单细胞转录组数据解读细胞酸盐轨迹.
Zhenyi Zhang1, Zihan Wang2, Yuhao Sun3
1LMAM and School of Mathematical Sciences, Peking University, Beijing, China.
NPJ systems biology and applications
|December 4, 2025
概括
本综述探讨了使用单细胞和空间奥米克数据进行动态细胞过程的计算建模. 先进的技术揭示了基因表达如何随着时间和空间的变化而变化,增强了我们对细胞生物学的理解.
科学领域:
- 计算生物学 计算生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 细胞过程是动态的,在时间和空间之间发生变化.
- 单细胞和空间奥米克技术提供高分辨率的基因表达数据.
- 描述动态细胞状态需要先进的分析方法.
研究的目的:
- 对时间序列和时空转录数据的最新建模策略进行审查.
- 突出动态系统,生成模型和生物见解之间的联系.
- 展示计算工具如何加深对单细胞动态的理解.
主要方法:
- 对计算建模方法的审查.
- 时间序列转录组数据的分析.
- 时间空间转录基因数据的分析.
主要成果:
- 确定动态转录基因数据的关键建模策略.
- 强调了动态系统和生成模型的集成.
- 演示计算工具在发现生物见解中的实用性.
结论:
- 计算建模对于理解动态细胞过程至关重要.
- 时间序列和时空转录组数据分析正在迅速发展.
- 这些方法为单细胞的动态性质提供了更深入的见解.


