枢纽基因分析心脏缺血/反损伤中的时间动态:生物信息学和实验研究
Yu Zuo1,2, Si-Yuan Yang1, Xing-Kai Qian2
1Cardiac Surgery Division, The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou, China.
Frontiers in physiology
|December 5, 2025
概括
心肌缺血/反损伤 (MIRI) 是一个严重的健康问题. 这项研究确定了四个关键基因 (Serpine1,Ccl2,Il6,Fn1) 作为MIRI的潜在诊断和治疗标,在细胞模型中得到验证.
科学领域:
- 心血管研究研究心血管研究
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 心肌缺血/反损伤 (MIRI) 是全球死亡的一个重要原因.
- 矛盾的是,在缺血后恢复血液流动可能会加剧心脏组织损伤.
- 确定可靠的生物标志物和MIRI的治疗点至关重要.
研究的目的:
- 为了确定与MIRI相关的关键基因在不同反阶段.
- 探索MIRI的诊断潜力和治疗目标.
- 提供对MIRI背后的分子机制的见解.
主要方法:
- 对MIRI数据集 (GSE160516) 的差异基因表达分析.
- 基因本体学和KEGG通路丰富分析.
- 使用Cytoscape和CytoHubba构建蛋白与蛋白相互作用网络并识别枢纽基因.
- 微RNA,转录因子和药物基因相互作用分析.
- 在HL-1心肌细胞中使用氧-葡萄糖剥夺/再输 (OGD/R) 模型进行验证.
主要成果:
- 在再输血后6小时,24小时和72小时确定了差异表达基因 (DEG).
- 包括Il1b,Cxcl2,Cd44,Il6,Fn1,Fcgr3,Ccl2和Cd68在内的顶级枢纽基因在不同的时间点被确定.
- 接收器操作特征 (ROC) 曲线分析显示了高的诊断潜力 (AUC 0.889-1.000).
- 在MIRI模型中,验证证实了Serpine1,Ccl2,Il6和Fn1的mRNA表达升高.
结论:
- 在MIRI中,Serpine1,Ccl2,Il6和Fn1被确定为显著改变的基因.
- 这四个基因显示出作为MIRI的诊断生物标志物和治疗点的潜力.
- 这些发现为管理MIRI提供了有价值的见解.
