通过网络药理学,生物信息学分析和细胞实验,识别和验证肝细胞癌中与icaritin相关的预后基因

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 药理学 药理学是指药理学的学科.
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 肝细胞癌 (HCC) 带来了严重的全球健康挑战,预后不佳.
• 伊卡里 (ICT) 是一种来自传统中医药的化合物,具有与HCC治疗相关的多向抗瘤特性.
• 在HCC中,ICT的精确机制仍然不完全理解,需要进一步调查.

研究的目的:

• 系统地探索ICT相关基因在HCC中的预后和治疗相关性.
• 阐明ICT在HCC中的抗瘤作用背后的分子机制.
• 开发基于ICT向基因的HCC患者结果的预测模型.

主要方法:

• 综合性方法结合生物信息学,网络药理学和实验验证.
• 使用WGCNA和差异表达分析识别ICT和HCC之间的重叠目标.
• 使用机器学习算法,生存分析和LASSO Cox回归的预后风险评分模型的开发.
• 分子对接,动力学模拟和体外实验以验证ICT目标相互作用和细胞效应.

主要成果:

• 确定了35个重叠的ICT-HCC目标,主要涉及细胞循环调节和糖解.
• 开发了一个四基因预后模型,有效地将HCC患者分为不同的风险组.
• 分子模拟证实了ICT与核心点的稳定结合;体外研究表明ICT抑制HCC细胞的增殖和迁移.
• ICT调节了特定的基因表达,包括CA9,UCK2和FABP5的下调,以及CYP2C9.9的上调.

结论:

• 调节ICT向基因可以有效地抑制HCC的进展.
• 这些ICT调节的基因有可能成为HCC的预后生物标志物.
• 针对ICT的基因代表了HCC治疗的有希望的治疗点.