在清细胞细胞癌中对棕化进行综合基因组和功能性鉴定

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 清细胞细胞癌 (ccRCC) 是一种具有有限治疗选择的侵袭性癌症.
• 棕化是一种关键的翻译后修饰,影响癌症的进展和免疫反应.
• 棕化在ccRCC预后和免疫疗法疗效中的作用尚不清楚.

研究的目的:

• 开发基于与棕化相关的基因的ccRCC的预后模型.
• 在ccRCC中调查棕化基因,瘤基因组学和免疫透之间的关联.
• 根据棕化基因签名,预测ccRCC患者的免疫治疗反应.

主要方法:

• 集成和协调多个ccRCC数据集.
• 使用101个机器学习算法和与棕化相关的基因构建了一个预后模型.
• 进行单细胞RNA测序,基因组分析 (TMB,CNV) 和评估免疫透.
• 验证了ZDHHC18在ccRCC细胞系中的作用.

主要成果:

• 与棕化相关的模型将ccRCC患者分为不同生存率的高风险和低风险组.
• 高风险患者表现出增加的瘤突变负担和副本数量的变化.
• 预计低风险患者对免疫疗法反应更好.
• ZDHHC18敲击抑制了ccRCC细胞的增殖,迁移和入侵.

结论:

• 与棕化相关的基因,特别是ZDHHC18,是ccRCC的潜在预后和预测生物标志物.
• 这些发现为ccRCC生物学提供了洞察力,并建议ZDHHC18作为治疗点.
• 向棕化通路可能会改善ccRCC治疗策略和患者的治疗结果.