使用免疫信息学方法设计针对与结直肠癌相关的肠道寄生虫的多表位疫苗
Fatemeh Karimzadeh1,2, Razieh Heidari2, Fatemeh Mahmoudi Lamooki3
1Student Research Committee, Shahrekord University of Medical Sciences, Shahrekord, Iran.
Scientific reports
|December 8, 2025
概括
使用经过验证的表位体开发出一种新型的仿真抗原疫苗,有望预防Cryptosporidium parvum和Schistosoma mansoni感染和相关癌症. 这种计算方法确保了广泛的覆盖范围和强大的免疫反应.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 计算生物学 计算生物学
- 疫苗开发 疫苗开发
背景情况:
- 由Cryptosporidium parvum和Schistosoma mansoni引起的胃肠道感染正在增加.
- 由于缺乏有效的治疗方法,需要开发疫苗来预防相关癌症.
- 经过实验验证的表位为疫苗设计提供了比预测表位更高的可靠性.
研究的目的:
- 通过计算设计一种针对C. parvum和S. mansoni. 的多表位组合抗原疫苗.
- 确保候选疫苗引发强大和持久的免疫反应,具有广泛的全球覆盖.
- 为了评估疫苗构造的稳定性,可制造性和免疫性.
主要方法:
- 利用IEDB数据库中的197个经过实验验证的C. parvum和S. mansoni的表位.
- 针对人类序列应用同质过器并进行HLA人口覆盖率分析.
- 设计了一种含有CTL,HTL和B细胞表位体,RpfE辅助剂和链接器的仿真抗原,随后进行了分子对接,免疫模拟,分子动力学和克隆.
主要成果:
- 选择了七个CTL,七个HTL和五个B细胞表位,具有广泛的HLA覆盖范围.
- 分子对接显示了表位和HLA等位体之间强烈的结合亲缘关系.
- 免疫模拟预测了强大的先天性和适应性免疫反应;与TLRs对接产生了显著的结合得分 (TLR2-TLR1的-179.8 ± 4.5 kcal/mol,TLR4-MD2的 -191.5 ± 3.4 kcal/mol).
- 分子动力学和结合自由能计算证实了疫苗受体复合物的稳定性和强烈亲和力.
- 在克隆中显示了E. coli的高效表达.
结论:
- 设计的仿真抗原是一种有前途的疫苗候选人,可以对抗C. parvum和S. mansoni.
- 计算验证支持其产生强烈免疫反应的潜力及其可制造性.
- 需要进一步的实验验证,以确认其有效性.
