超越隐喻:瓦丁顿景观的定量重建和细胞行为的探索
Yourui Han1, Bolin Chen1,2, Jinlei Zhang1
1School of Computer Science, Northwestern Polytechnical University, 1 Dongxiang Road, Chang'an District, Xi'an 710072, China.
Briefings in bioinformatics
|December 10, 2025
概括
沃丁顿的景观,一个胚胎发育的概念比喻,正在转变为一个定量框架. 单细胞奥米克和计算建模方面的进步使细胞命运决定的预测重建成为可能.
科学领域:
- 系统生物学 系统生物学
- 发展生物学 发展生物学
- 生物物理学的生物物理.
背景情况:
- 瓦丁顿景观是一个概念比喻,说明胚胎发育和细胞状态稳定.
- 这种景观的定量重建是系统生物学和生物物理学的重大挑战.
- 最近的进展为其定量分析提供了新的可能性.
研究的目的:
- 审查瓦丁顿景观的理论基础.
- 将其重建的计算和数学方法分类.
- 突出这些方法的应用和局限性.
主要方法:
- 对瓦丁顿景观的理论基础进行回顾.
- 计算和数学重建方法的分类.
- 在描述细胞行为和预测细胞命运方面的应用分析.
主要成果:
- 方法上的进步正在使瓦丁顿景观的定量重建成为可能.
- 这种转变将景观从启发性隐喻转变为预测框架.
- 重建存在各种方法,每个方法都有特定的应用和局限性.
结论:
- 瓦丁顿景观正在演变为一个量化预测工具.
- 计算和欧米克技术是这种转型的关键驱动力.
- 了解景观动态对于预测和调节细胞命运决策至关重要.


