在林奇综合征的分子诊断中应用NGS和MLPA方法
Ivana Rako1,2, Ema Vinceljak2, Marina Popovic3,4
1Clinical Department of Laboratory Diagnostics, University Hospital Center Zagreb, 10000 Zagreb, Croatia.
Diagnostics (Basel, Switzerland)
|December 11, 2025
概括
将下一代测序 (NGS) 与多重结合依赖探针放大 (MLPA) 结合起来,显著改善了林奇综合征 (LS) 诊断. 这种双层方法通过检测NGS单独错过的大型基因组重组来增加诊断产量,有助于癌症风险评估.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 林奇综合征 (LS) 是一种与DNA不匹配修复 (MMR) 基因缺陷相关的遗传性癌症倾向.
- 在MMR基因 (MLH1,MSH2,MSH6,PMS2,EPCAM) 中的生殖系致病变体 (PVs) 或可能致病变体 (LPVs) 导致LS.
- 大规模的基因组重组构成了超过20%的MMR基因变异,这给诊断带来了挑战.
研究的目的:
- 用NGS和MLPA评估林奇综合征的双层诊断策略.
- 通过将MLPA纳入副本数变异 (CNVs) 来提高LS患者的诊断产量.
主要方法:
- 60名疑似LS患者接受了遗传咨询和检测.
- 用NGS多基因面板测试分析了113个癌症易感基因的DNA.
- MLPA用于NGS阴性样本,以检测大删除和重复 (CNV).
主要成果:
- 在10名患者中,NGS确定了致病变体 (PVs).
- 在另外7名患者中,MLPA检测到致病性CNV,包括MLH1和MSH2的缺失.
- 结合NGS-MLPA方法使诊断灵敏度增加了11.6% (从16.7%增加到28.3%),其中CNV占所有致病发现的41%.
结论:
- MLPA是林奇综合征分子诊断的一个有价值的工具.
- 将MLPA与NGS多基因面板测试集成,可以提高诊断产量,并有利于患者的护理.
- 这种全面的方法提高了对病原体变异的检测,包括对LS管理至关重要的CNV.
