在丝状真菌Trichoderma atroviride中构建一个随机条码的插入突变库

科学领域:

• 菌类学 菌类学是指菌类学.
• 基因组学就是基因组学.
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 丝状真菌在生态系统,农业和医学中至关重要.
• 鉴定这些真菌中的基因功能是具有挑战性的,因为转化效率低和多核细胞.
• 高通量选方法在线状真菌中是有限的.

研究的目的:

• 开发一种可扩展的平台,用于状真菌中的高通量功能基因组学.
• 在Trichoderma atroviride中构建一个全基因组条码插入突变库.
• 为了克服状真菌的基因功能表征的局限性.

主要方法:

• 利用来自等离子体库的随机条形码转移DNA插入.
• 雇佣了Agrobacterium tumefaciens用于将DNA输送到Trichoderma atroviride中.
• 优化了转换条件,以最大限度地提高转换剂的产量.

主要成果:

• 在Trichoderma atroviride中构建了一个全基因组条码插入突变库.
• 在每次感染事件中达到多达600个独立变换剂.
• 绘制了超过31,000个插入,破坏了T. atroviride基因组中的7104个基因.

结论:

• 在状真菌中建立了一个可扩展的高通量功能基因组学平台.
• 突变图书馆促进了基础研究和工程应用.
• 促进了真菌生物学,医学,生物技术和农业的进步.