对响应Bipolaris sorokiniana的小麦微RNA的全基因组识别,表达和监管网络分析

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 斑点斑点是由*Bipolaris sorokiniana*引起的,对全球小麦产量产生重大影响.
• 开发具有增强斑点抗性的小麦对于粮食安全至关重要.
• 微RNAs (miRNAs) 是植物病原体相互作用中的基因表达的关键调节者.

研究的目的:

• 在感染*B. sorokiniana*的耐药和易受性小麦基因型中对miRNA进行分析.
• 为了识别差异表达的miRNA及其参与小麦防御的基因.
• 为了阐明小麦-*B. sorokiniana*病理系统中的miRNA介导的调节网络.

主要方法:

• 小RNA测序被用于对抗性 (IC566637) 和敏感性 (Agra Local) 小麦中的miRNA进行分析.
• 进行了生物信息分析,包括基因本体学 (GO) 和基因和基因组 (KEGG) 丰富的京都百科全书.
• 使用定量RT-PCR (qRT-PCR) 来验证miRNA和目标基因表达.

主要成果:

• 总共有726个miRNA被确定,其中140个基因型之间的差异表达 (DE).
• 德微RNA的目标是894个参与二次代谢物,ABC载体,NB-LRR,MAPK信号传递和激素通路的基因.
• 一个监管网络突出了关键的miRNA-目标相互作用,可能会赋予疾病耐药性.
• qRT-PCR验证了九种选定的miRNA及其点在小麦防御中的作用.

结论:

• 这项研究提供了一个全面的资源,以了解小麦斑点斑点中的miRNA调节.
• 已识别的miRNA和目标基因是小麦耐药性繁殖和基因组编辑的有希望的候选者.
• 阐明这些分子机制可以导致小麦中持久的抗病策略.