针对流细胞计和单细胞RNA测序处理小鼠瘤载体肺组织的优化协议
Sicong Wang1, Anastasiia Ivanova1, Helen P Makarenkova1
1The Scripps Research Institute, Department of Molecular and Cellular Biology.
bioRxiv : the preprint server for biology
|December 15, 2025
概括
这项研究提出了一种新方案,用于从小鼠肺组织中分离高质量的单细胞,这对于理解非小细胞肺癌 (NSCLC) 异质性使用单细胞RNA测序至关重要.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 非小细胞肺癌 (NSCLC) 是最常见的肺癌,KRAS突变很常见.
- 在NSCLC中,瘤异质性和可塑性仍然不太清楚.
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 对于研究细胞异质性至关重要.
研究的目的:
- 从健康的和瘤携带的小鼠肺部中分离出高质量的单细胞悬浮液的强有力的协议.
- 为了实现肺癌模型的有效scRNA-seq分析.
- 为了促进NSCLC异质性和Kras驱动的瘤发生的研究.
主要方法:
- 来自小鼠肺部的单细胞悬浮制剂的详细协议.
- 包括组织输液,酶性消化,机械解离,红细胞溶解和过.
- 使用KrasG12D; tdTomato记者小鼠模型进行瘤细胞识别.
主要成果:
- 实现了适合scRNA-seq.的>85%可活单细胞.
- 通过光激活细胞分类 (FACS) 成功分离了tdTomato+瘤细胞.
- 在scRNA-seq分析中显示出明显的瘤细胞集群.
结论:
- 开发的协议从复杂的肺组织中产生高质量的单细胞悬浮液.
- 这种方法对于在NSCLC研究中推进scRNA-seq研究至关重要.
- 能够在单细胞水平上详细研究克拉斯突变肺癌生物学.
