BeadBuddy:一个单分子成像数据的用户友好,纳米级记录
Finnegan T Clark1,2, Peter H Whitney1, Néstor Saiz1
1Institute for Systems Genetics, NYU Grossman School of Medicine, New York, NY, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|December 15, 2025
概括
我们开发了BeadBuddy,这是一个新的软件,用于纠正单分子局部化显微镜 (SMLM) 成像中的复杂色谱错误. 这种工具提高了纳米尺度生物研究的精度,使用光成像.
科学领域:
- 显微镜的使用方法
- 生物物理学的生物物理.
- 光学成像技术的成像
背景情况:
- 单分子定位显微镜 (SMLM) 在光成像中提供纳米分辨率.
- 越来越复杂的色差误差来自于先进的SMLM技术,如大面积相机和多重成像.
- 这些色谱错误阻碍了SMLM数据的准确定量分析.
研究的目的:
- 开发一种开源软件解决方案,用于3D建模和纠正SMLM中的空间变色错误.
- 提高SMLM数据分析的精度和可靠性,特别是在具有挑战性的成像条件下.
主要方法:
- 使用光珠的图像来创建染色偏差校正模型.
- 开发了BeadBuddy,这是一个用户友好的软件工具,实现了开发的校正模型.
- 应用软件来纠正3D SMLM数据集中的色彩错误.
主要成果:
- 通过光珠成像成功建模和纠正3D,空间变化的色彩错误.
- 在经过校正后的DNA光现场混合 (FISH) 实验中证明了亚声素分辨率.
- 验证了BeadBuddy在各种SMLM模式中的适用性.
结论:
- BeadBuddy有效地解决了SMLM中复杂的色差异.
- 该软件能够实现更精确的纳米尺度成像和分析,特别是对于DNA FISH.
- BeadBuddy是一个适用于广泛的SMLM技术的多功能工具.
