水产养殖实践对Vibrio种群动态和微生物群的影响
Esam Almuhaideb1, Nur A Hasan2,3, Christopher Grim4
1Department of Agriculture, Food and Resource Sciences, University of Maryland Eastern Shore, Princess Anne, Maryland, USA.
养殖水产养殖实践显著改变了的微生物群,影响了病原体水平. 浮式子显示出更高的Vibrio代表性,而底层更多的是新鲜,突出了动态监测的必要性.
科学领域:
- *海洋微生物学和水产养殖科学.
- * 食品安全和公共卫生.
- *环境基因组学和生物信息学.
背景情况:
- *养殖对可持续食品至关重要,但致病性Vibrio parahaemolyticus (Vp) 和Vibrio vulnificus (Vv) 引起疾病.
- *了解水产养殖系统如何影响的微生物群落和病原体存在对于食品安全至关重要.
研究的目的:
- * 调查底部水产养殖与浮水产养殖对微生物群和活菌水平的影响.
- * 分析温度滥用对这些微生物动态的影响.
- * 为了比较元基因组测序和定量PCR方法的结果.
主要方法:
- *每月从切萨皮克湾的和水中取样和浮系统 (2019年6月至11月).
- *使用最可能的数量和实时PCR (MPN-qPCR) 来量化总和致病性维.
- * 用和水DNA的枪支元基因组测序来分析微生物群落,菌体和耐药基因.
主要成果:
- *水产养殖实践显著改变了微生物群的多样性,影响了菌体,抗生素耐药性和毒性基因.
- *元基因组测序显示,新鲜和温度滥用的在漂浮中的Vibrio遗传代表性更高.
- *MPN-qPCR显示,新鲜的底中,但在温度滥用的浮动中,Vibrio较高,这表明方法和条件的具体差异.
结论:
- *养殖水产养殖实践对的微生物群和振动力学有重大影响.
- *需要一个整体的,时间敏感的方法来理解水产养殖方法,微生物状态和环境因素之间的复杂相互作用.
- *先进的元基因组工具适用于未来的食品安全和水产养殖管理研究.
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