从鱼片中分离出的Listeria monocytogenes 64_37的全基因组序列数据

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 食品安全 食品安全

背景情况:

• 李斯特菌 (Listeria monocytogenes) 是一种主要的食源性病原体,是导致李斯特菌病的重要病原体.
• 鱼类产品可以作为李斯特菌单细胞菌向人类传播的载体.

研究的目的:

• 为了执行从鱼片中分离出的Listeria monocytogenes 64_37菌株的全基因组测序 (WGS).
• 鉴定菌株的基因组特征,病原性潜力和抗菌素耐药性基因的特征.

主要方法:

• 使用Illumina技术和基于参考的组装进行全基因组测序.
• 多部位序列类型化 (MLST) 用于菌株特征化.
• 使用子系统技术 (RAST) 服务器快速注释的功能注释.
• 全基因组分析以确定独特的基因.

主要成果:

• 获得了L. monocytogenes 64_37菌株的高质量基因组序列,检测到了rep26型复制体的等离子体.
• 该菌株被分配到血清组IIa和序列类型 (ST) 204 (克隆复合体CC204).
• 该基因组含有多个毒性基因和与对林科萨米德,性,胺素和诺基诺的耐药性相关的基因.

结论:

• 整个基因组序列提供了对Listeria monocytogenes 64_37.37 菌株的全面了解.
• 已识别的毒性和抗菌素耐药性基因突出显示了这种在鱼类中发现的菌株的病原性潜力.
• 这些基因组数据对未来对鱼类产品中的Listeria monocytogenes的研究和公共卫生风险评估有价值.