通过使用临床样本进行综合性转录基因分析和验证,解开清细胞细胞癌的分子景观
Amir Taherkhani1, Simindokht Sarvmeili2, Hamed Manoochehri3
1Research Center for Molecular Medicine, Institute of Cancer, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran.
Biochemistry and biophysics reports
|December 17, 2025
概括
这项研究确定了包括FOXM1在内的五个关键基因,这些基因可以预测清细胞细胞癌 (ccRCC) 的预后. 发现FOXM1在ccRCC中被上调,突出了它在癌中的作用.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 清细胞细胞癌 (ccRCC) 是最常见的癌亚型,通常具有攻击性和不良结果.
- 识别预后生物标志物和理解分子驱动因素对于有针对性的治疗和改善患者治疗结果至关重要.
- 这项研究旨在发现参与ccRCC发育和进展的关键基因和途径.
研究的目的:
- 在ccRCC中识别差异表达基因 (DEGs).
- 构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并识别关键的枢纽基因.
- 评估枢纽基因的预后价值,并在ccRCC中预测上游调节者.
主要方法:
- 重新分析GSE66270数据集,比较ccRCC瘤和正常组织.
- 构建蛋白质-蛋白质相互作用网络以识别枢纽基因和通路.
- 预后评估的生存分析和上游调节器预测的iRegulon.
主要成果:
- 为ccRCC分层建立了一个五基因预后签名 (FCGR1A,FOXM1,TOP2A,BIRC5,CCNA2).
- FOXM1被确定为一个关键的上游调节器,并且在ccRCC组织中被显著上调 (p<0.001).
- 实时PCR证实了癌组织中枢基因的表达.
结论:
- 识别的基因特征为ccRCC提供了预后见解.
- 在ccRCC的发病过程中,FOXM1起着至关重要的作用.
- 这些发现强调了ccRCC中分子通路和免疫系统的重要性.
