扩大心脏血管相互作用网络:CrsL是一种新型的转录调节器在actinobacteria

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 遗传学是一种遗传学.

背景情况:

• 细菌转录调节对于适应至关重要.
• CarD是菌根菌中的一个关键的转录因子.
• CarD的相互作用伙伴以前是未知的.

研究的目的:

• 为了在Mycobacterium smegmatis.中识别新型的CARD相互作用伙伴.
• 为了描述已识别的蛋白质的功能,CrsL.
• 阐明CrsL在真菌细菌应激反应中的作用.

主要方法:

• 蛋白相互作用研究以确定心脏病的合作伙伴.
• 核磁共振 (NMR) 光谱法用于确定蛋白质结构.
• 染色体免疫沉测序 (ChIP-seq) 用于绘制基因组结合部位的地图.
• RNA测序 (RNA-seq) 用于分析基因表达变化.
• 在各种温度条件下进行生长测试.

主要成果:

• 一种新型蛋白质CrsL被确定为心脏病相互作用伙伴.
• CrsL是一种内在无序的蛋白质,在结合 CarD.时采用有序结构.
• CrsL与RNAP结合,并调节了CARD与RNAP的关联.
• CrsL和CARD共同定位在积极转录的基因的促进者.
• CrsL knockdown 影响基因表达方式类似于 CarD knockdown,特别是在应激反应基因中.
• 在不同的温度下,CrsL会影响细菌的生长,在高温下支持细菌的生长,但在寒冷的条件下会限制细菌的生长.

结论:

• CrsL是一种新型的,保存的蛋白质,与真菌细菌中的CarD相互作用.
• 在调节基因表达和调节应激反应方面,CrsL发挥着重要作用.
• CrsL调节心脏功能,影响细菌适应环境变化.