解密病毒宿主相互作用分析,以解开核心病毒网络签名和用于宫癌的计算药物重定位
Sarangthem Dinamani Singh1, Selvaraman Nagamani1
1Advanced Computation and Data Sciences Division, CSIR-North East Institute of Science and Technology (NEIST), Jorhat, Assam, 785006, India; Academy of Scientific and Innovative Research (AcSIR), Ghaziabad, India, 201002.
这项研究确定了参与宫癌 (CC) 的关键人类乳头瘤病毒 (HPV) 蛋白质,并提出了针对这些病毒性瘤蛋白的潜在抗病毒药物,以对抗HPV驱动的瘤发生.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 病毒学 病毒学
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 宫癌 (CC) 仍然是全球癌症死亡的重要原因.
- 人类乳头瘤病毒 (HPV),特别是HPV16和HPV18,是CC的主要致病因子.
- 驱动HPV诱导癌症发病和进展的精确分子机制尚未完全阐明.
研究的目的:
- 在HPV与宿主相互作用网络中识别关键的病毒蛋白和分子标,这些标与宫癌发生有关.
- 确定病毒蛋白上的短线性图案 (SLiM) 作为潜在的治疗干预地点.
- 发现新型抗病毒药物候选物,有效对抗HPVcoproteins.
主要方法:
- 病毒与宿主相互作用的网络分析和CC蛋白质组数据.
- 在关键HPV蛋白 (VE7_HPV16,VE6_HPV18) 中识别和表征短线性图案 (SLiM).
- 在体验证,包括活性部位预测,蛋白质-蛋白质对接和潜在抗病毒药物的基于结构的虚拟查.
主要成果:
- 两个关键的病毒蛋白,VE7_HPV16和VE6_HPV18,被确定在HPV驱动的瘤发生过程中至关重要.
- 这些蛋白质内的短线性动图 (SLiM) 被突出显示为潜在的治疗点.
- 十种抗病毒药物候选药物,包括Pleconaril,Pirodavir,Saquinavir,Delavirdine,Tipranavir,Beclabuvir,Velpatasvir,Paritaprevir,Odalasvir和Ledipasvir,它们对各自的标具有很高的结合亲和力.
结论:
- 这项研究成功地确定了关键的HPV蛋白标和子宫癌的潜在治疗策略.
- 拟议的抗病毒药物候选人为阻止HPV在子宫癌发生中的作用提供了有希望的途径.
- 对这些已识别的标和候选药物的进一步研究可能会导致新的CC治疗方法.
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