通过编码和非编码RNAs对Pelodiscus sinensis生长和免疫调节的TCM影响的全转录组分析

科学领域:

• 水产养殖是水产养殖的一种方式.
• 基因组学就是基因组学.
• 免疫学 免疫学 免疫学

背景情况:

• 在Pelodiscus sinensis水产养殖中,传统的治疗方法面临着局限性.
• 传统中国医药 (TCM) 为水产养殖提供了一个可持续的替代品.
• 了解P. sinensis中TCM的分子机制对于优化它们的使用至关重要.

研究的目的:

• 通过全转录组分析研究TCM对P. sinensis生长和免疫调节的影响.
• 识别由TCMs影响的关键差异表达基因 (DEGs) 和非编码RNA.
• 阐明涉及P. sinensis.中TCM反应的分子途径和调节网络.

主要方法:

• 在暴露于不同剂量的TCM的P. sinensis上进行了全转录组测序.
• 不同基因表达分析确定了不同的DEG子集 (SpTG1,SpTG2,TG1_TG2).
• 生物信息工具被用于分析富化通路 (例如PI3K-Akt,TNF,AMPK) 和在竞争的内源RNA (ceRNA) 网络中的非编码RNA相互作用 (miRNA,circRNA,lncRNA).

主要成果:

• 确定了三个不同的DEG子集,显示了对TCM的剂量依赖反应.
• 对TCM敏感的DEG在生长,新陈代谢和免疫的关键途径中得到了显著的丰富.
• 该研究确定了miRNAs,circRNAs和lncRNAs在中介TCM效应中的作用,突出了潜在的ceRNA调节机制.

结论:

• 通过复杂的基因和非编码RNA调节网络,TCM可以有效调节P. sinensis的生长和免疫反应.
• 确定了分子途径和目标,为开发基于TCM的水产养殖战略提供了基础.
• 作为可持续和环保的料添加剂,TCM显示出增强P. sinensis水产养殖生产的希望.